Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PHIPQ8WWQ0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PHIPQ8WWQ0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms