Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VWA5B2Q8N398 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VWA5B2Q8N398 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms