Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms