Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J2

C16orf62, UPF0505 protein C16orf62, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf62Q7Z3J2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C16orf62Q7Z3J2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C16orf62Q7Z3J2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms