Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
USP34Q70CQ2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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