Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CXCL17Q6UXB2 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms