Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
DUX4L9Q6RFH8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms