Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ANKRD54Q6NXT1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ANKRD54Q6NXT1 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms