Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRAMD4Q6IC98 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms