Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms