Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEF1DP3Q658K8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEF1DP3Q658K8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEF1DP3Q658K8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EEF1DP3Q658K8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EEF1DP3Q658K8 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms