Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
C9orf135Q5VTT2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms