Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms