Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms