Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KLHL12Q53G59 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms