Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PKDCCQ504Y2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms