Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KNOP1Q1ED39 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KNOP1Q1ED39 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms