Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IMPG1Q17R60 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IMPG1Q17R60 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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