Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDO1Q16878 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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