Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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PTPRNQ16849 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRNQ16849 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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