Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DDR2Q16832 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDR2Q16832 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms