Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PCK2Q16822 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PCK2Q16822 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms