Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SNAPC1Q16533 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SNAPC1Q16533 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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