Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TRIP13Q15645 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TRIP13Q15645 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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TRIP13Q15645 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TRIP13Q15645 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms