Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
TAF1AQ15573 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TAF1AQ15573 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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