Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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SS18Q15532 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SS18Q15532 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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