Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ARHGEF6Q15052 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms