Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAM2Q15035 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAM2Q15035 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAM2Q15035 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TRAM2Q15035 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRAM2Q15035 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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