Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HERC3Q15034 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms