Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms