Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PTPRCAPQ14761 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms