Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
COL4A6Q14031 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms