Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PKP1Q13835 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms