Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ALCAMQ13740 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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