Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TCIRG1Q13488 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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