Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMAD4Q13485 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD4Q13485 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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