Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTK7Q13308 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTK7Q13308 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms