Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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NME3Q13232 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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