Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRIK2Q13002 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms