Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HSPB3Q12988 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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