Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TROQ12816 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TROQ12816 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TROQ12816 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TROQ12816 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TROQ12816 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TROQ12816 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TROQ12816 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TROQ12816 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TROQ12816 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TROQ12816 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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