Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC173Q0VFZ6 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms