Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOBRQ0VD83 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOBRQ0VD83 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms