Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SYCNQ0VAF6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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