Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSRP1Q08945 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms