Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TGM3Q08188 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TGM3Q08188 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms