Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHRNB3Q05901 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms