Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPCQ03188 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPCQ03188 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms