Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PLOD1Q02809 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms