Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms